衡水车务段行政机构设办公室、安全科、技术科、运输和统计科、信息技术科、计划财务科、劳动人事科、职工教育科、房产设备管理科；党群组织设党委、纪委、工会、团委。辖区横跨北京市大兴区，天津市北辰区、武清区，河北省石家庄市、衡水市、廊坊市、沧州市、邢台市，山东省德州市。